Juktån är ett större biflöde till Umeälven som rinner upp i sjön Överst-Juktan i fjällen mellan Tärnaby och Ammarnäs. Den flyter sedan mot sydost till den långsmala sjön Fjosoken som därefter direkt följs av sjön Stor-Juktan. Härefter blir sjöarna i flodsträckan betydligt mindre när ån fortsätter mot sydost och senare söderut ner mot Gunnarn där ån vidgas inför sammanflödet med Umeälven vid Åskilje ytterligare en mil längre mot sydost. Åns nedre del är påverkad av vattenkraft genom dammen vid Storjuktan. Det vatten som används för elproduktion där leds efter att ha passerat genom turbinen genom en lång tunnel till sjön Storuman i Umeälven och flyter därmed inte genom Juktåns nedre del.
Inlandsbanan korsar Juktån på en stålfackverksbro i ett spann vid södra infarten till Lomselenäs. Ett par hundra meter söder om bron finns en mindre bro över södra änden av den långsmala sjön Lomavan som ligger parallellt med Juktån. Väg E45 passerar ån på en bro inom synhåll något längre nedströms.