Stationshuset i Mellansel ritades av SJ:s dåvarande chefsarkitekt Adolf Edelsvärd som ett av hans totalt 26 modellhus. Mellanselsmodellen har precis som den större Vännäsmodellen fornnordiska drag med fasader av liggande timmer med utstickande timmerknutar, fasadtimret fick behålla sin runda form och var endast avbarkat. Den något asymmetriska Mellanselsmodellen fick stor detaljrikedom och blev därför dyr att uppföra, så dyr att den endast kom att byggas i sin ursprungliga form i just Mellansel. När Edelsvärd ville använda samma modell i Jörn blev villkoret att modifiera ritningarna för att sänka kostnaderna, så skedde också varför ett liknande hus finns även där.
Stationshuset byggdes på södra sidan av bangården, den sida som stationssamhället sedan växte upp på. Huset är idag välbevarat och har inte genomgått någon större om- eller tillbyggnad sedan det stod klart i början av 1890-talet. Väster om stationshuset har flera andra byggnader med anknytning till järnvägen funnits. Drygt 200 meter väster om stationshuset finns en byggnad som bör ha varit någon typ av bostadsbyggnad, här finns också ett uthus.