Stationshuset vid Boden C är stationens tredje stationshus och byggdes i mitten av 1890-talet. 1887 köpte det engelska järnvägsbolaget den Ekbeckska gården för att ha huvudbyggnaden som stationshus. Redan två år senare byggdes emellertid ett nytt stationshus. När dagens stationshus stod klart i samband med att Boden blev knutpunkt mellan malmbanan och stambanan fick det tidigare stationshuset tillfälligt fungera som järnvägshotell. 1897 uppfördes ett nytt järnvägshotell norr om stationshuset och därefter kunde det gamla stationshuset rivas. Stationshuset byggdes till 1917 och 1925 då det fick sin norra respektive södra flygel. Bodens järnvägshotell totalförstördes i en brand 1975.