Övertorneå var den norra ändpunkten på statsbanan Karungi–Övertorneå och stationen öppnades samtidigt som banan i december 1914. Efter att persontrafiken och godstrafiken på banan lagts ned 1984 respektive 1986 och banan rivits upp 1992 används stationshuset nu i stället som flerbostadshus, det gamla godsmagasinet söder om stationshuset var under rivning 2009.