Arlanda södra är den södra av de två stationer som Arlanda Express trafikerar på flygplatsen och är belägen mellan terminal 4 i norr och terminalerna 2 och 3 i söder. Stationen ligger i tunnel och har en plattform med två spår, 4 och 5. Tågen kör normalt högertrafik och tåg mot Stockholm avgår därför vanligen från spår 4.